Der Träger der Einrichtung ist die Sozialwerk Heilig Kreuz gemeinnützige GmbH, Kreszentiaheimstraße 43, 84503 Altötting, eine Tochtergesellschaft der Stiftung Heilig Kreuz Altötting und der Marienheim Mussenhausen gemeinnützige GmbH.
Sowohl die genannte Stiftung wie auch die beiden gemeinnützigen GmbHs wurden von dem Provinz- und Missionshaus Heilig Kreuz, und somit von den Schwestern vom Heiligen Kreuz in Altötting gegründet.
Den Ordensgründern P. Theodosius Florentini (1808–1865) und M. Bernarda Heimgartner (1822–1863) war es ein Anliegen, »sich auf die Not der Menschen unserer Zeit« einzulassen, denn »das Bedürfnis der Zeit ist der Wille Gottes«.
Im Haus St. Josef wird diese Leitidee als Auftrag verstanden, bestmögliche pädagogische Angebote für Kinder, Jugendliche und Familien in unterschiedlichen Situationen bereit zu stellen. Neben fachlich qualifiziertem Personal und dem ganzheitlichen Ansatz sind das christliche Welt- und Menschenbild tragende Säulen unserer Pädagogik.